Både Østfoldbanen og veien over planovergangen ble sperret som følge av påkjørselen som politiet meldte om i 15.45-tiden.
Operasjonsleder Ronny Samuelsen i Øst politidistrikt sier til Moss Avis at godstoget skjøv bilen rundt 50 meter bortover toglinjen ved nordre planovergang i byen.
– Vi har full prioritet på å få fjernet bilen og få Østfoldbanen i gang igjen, men frem til da vil det bli kaotisk i trafikken, sier Samuelsen.
Ingen kom til skade i påkjørselen, som skyldes uaktsomhet fra bilføreren.
– Hun ble stående på selve toglinjen i kø da bommene gikk ned. Hun kom seg heldigvis ut, men det er helt forbudt å stå i kø på en overgang, sier operasjonslederen.
Kvinnen, som er i 50-årene og kommer fra Rygge, vil miste førerkortet, opplyser politiet.
Torsdag ettermiddag pågikk arbeidet for fullt med å få fjernet bilen, som er totalvrak etter sammenstøtet med godstoget. Politiet antyder at ryddingen vil ta noe tid.
I år faller også den internasjonale planovergangsdagen, som markeres for å minne om farene ved kryssing av planoverganger, tilfeldigvis på den 7. juni. Hvert år feires denne dagen i begynnelsen av juni, ifølge Samferdselsdepartementet.