NATO har bekreftet å ha gjennomført flyangrep i området.
Angrepet skjedde tidlig torsdag, etter at to amerikanske soldater og tre afghanske spesialsoldater ble drept i en skuddveksling i Kunduz.
– Afghanske styrker og NATO-styrker gjennomførte en felles operasjon mot Taliban-opprørere. I et bombeangrep ble 30 sivile afghanere drept og 25 andre såret, sier Mahmood Danish, talsmann for provinsmyndighetene.
– Angrepet mens de sov
En polititalsmann oppgir det samme dødstallet og la til at spedbarn ned til tre måneders alder var blant ofrene.
Bilder publisert i sosiale medier viser en rekke døde barn med store skader som angivelig skal ha blitt drept i angrepet. Bildene er for sterke til at Aftenposten kan gjengi disse.
– De sov da huset deres ble angrepet av koalisjonsstyrkene, sier Mahmoodullah Akbari.
NATO har vedgått at det var deres fly som sto bak angrepene.
– Det ble gjennomført flyangrep i Kunduz for å forsvare vennligsinnede styrker under ild. Alle påstander om sivile tap vil bli undersøkt, het det i en Twitter-oppdatering.
Angrepet utløste umiddelbare demonstrasjoner i Kunduz. Titalls mennesker tok med seg likene av sine døde og samlet seg utenfor guvernørens hus.
Angrep posisjon
I forkant av luftangrepet hadde amerikanske og afghanske soldater angrepet en av posisjonene til Taliban.
General Qasim Jangalbagh sier 65 Taliban-krigere ble drept, deriblant to kommandanter.
I begynnelsen av oktober klarte Taliban-krigere å innta og holde provinshovedstaden Kunduz en kort periode. Også i fjor klarte opprørerne å ta byen, før afghanske styrker igjen fikk kontrollen noen uker senere. Det skjedde med hjelp av amerikanske luftangrep, angrep som også rammet Leger uten grensers sykehus i byen. 42 mennesker ble drept her.
USA leder NATOs innsats for å trene og bistå afghanske styrker. NATO-operasjonen kalt Resolute Support omfatter 12.000 soldater, blant dem norske.
USA-ledede styrker invaderte Afghanistan i 2001, som den gang var styrt av Taliban.