Chérif Chekatt ble observert i en gate i Strasbourg, og politiet aksjonerte, opplyste innenriksminister Christope sent torsdag kveld.
Politiet forsøkte først å pågripe ham, men han skjøt mot politiet, fortalte statsråden til frammøtte pressefolk i Strasbourg.
– De besvarte ilden umiddelbart og nøytraliserte angriperen, sa Castaner.
Flere titall politikjøretøy var på stedet.
– Vi er lettet (...). Dette vil hjelpe oss å komme tilbake til et normalt liv, sa borgermesteren i Strasbourg, Roland Ries.
Chekatt er mistenkt for å ha skutt og drept tre personer på et julemarked i Strasbourg tirsdag.
Ytterligere 13 personer ble skadet i angrepet. Innenriksminister Christophe Castaner sa torsdag kveld at tre av dem «svever mellom liv og død».
Fem pågrepet
Store politistyrker har jaktet på Chekatt de siste dagene.
Fransk påtalemyndighet opplyste til DPA etter aksjonen torsdag ettermiddag at en femte person er blitt pågrepet.
De fire som fra før er pågrepet i saken, er 29-åringens foreldre og to av hans brødre. I tillegg ble søsterens Paris-hjem gjennomsøkt og hun ble avhørt som vitne, skriver Le Figaro.
Tre mistet livet
Fransk politi har vært i høy beredskap helt siden angrepet mot julemarkedet i Strasbourg tirsdag, der tre personer ble drept og 13 såret. Kort tid etter angrepene tirsdag skal en taxisjåfør ha satt av 29-åringen i det aktuelle området som nå er sperret av, ifølge politiet.
Torsdag ble et tredje offer erklært død etter angrepet. I tillegg har en fjerde person ligget hjernedød siden tirsdag kveld.
En thailandsk turist var blant de drepte. Mannens kone overlevde. En fransk mann som ventet på sin familie utenfor en restaurant, ble også offer for angrepet. Den tredje drepte var en mann født i Strasbourg, med afghansk bakgrunn.
Internasjonal jakt
En talsmann for franske myndigheter, Benjamin Griveaux, sa torsdag til fransk TV at mer enn 700 politifolk og sikkerhetsstyrker deltok i jakten på Chekatt.
29-åringen har vært jaget i flere europeiske land, og både Frankrike og Tyskland har skjerpet grensekontrollen. Myndighetene fryktet at Chekatt skulle rekke å flykte fra landet. Etter terrorangrepet i Paris i november 2015 tok det politiet fire måneder å finne den eneste gjenlevende gjerningsmannen, som ble pågrepet i Brussel i mars 2016.
1.800 soldater ble i tillegg utplassert rundt om i Frankrike for å sikre gater og områder med mange folk, opplyser Griveaux. Han oppfordret samtidig bevegelsen «de gule vestene» om å avstå fra nye demonstrasjoner i helgen.
Terror
Strasbourg-angrepet etterforskes som en terrorhendelse. Chekatt skal ha ropt «Allahu Akbar» (Gud er stor) da han begynte å skyte rundt seg på julemarkedet på Kleber-plassen i sentrum av Strasbourg ved 20-tiden tirsdag kveld.
Terrornivået i Frankrike er hevet til høyeste nivå.